病死畜禽是畜牧業生產中一定遇到的產物，其處理方式受畜禽死亡率和養殖模式影響。
1.散養
20世紀70年代以前，我國的養殖業基本上處于農村散養狀態，那時的養殖總量小，死亡率低，即使出現死亡，數量不大，通過深埋等簡易方式就可以處理掉。當前的畜牧業已經發展到了一個新階段，動物的存欄量、出欄量都有了成十幾倍的增長。以2012年的生豬為例，全國年末存欄量達到47 492萬頭，出欄69 628萬頭，按照10%的死亡率計算，每年約7 000萬頭畜禽死亡。養殖模式也由單純的散養轉變為散養、作坊式養殖、小型規模化養殖和大型企業化養殖等多種養殖模式共存的局面。簡單的深埋方式已經不能滿足病死畜禽處理的需要。
三種飼養模式中，散養畜禽量占的比例很小，即使發病死亡，數量不多，容易處理，通過簡易的深埋、焚燒等方式就可以處理掉。以山東東營墾利縣的家禽養殖為例，全縣存欄家禽90萬羽，散養家禽不足1萬羽，所占比例不足1%。散養生豬、牛、羊的比例也不足3%。散養方式對畜禽死亡量的影響很小。大型企業化養殖的數量在畜牧業總量中占有一定的比例，但它們的管理能力較強，從業人員的技術水平較高，畜禽死亡率低，死亡數量也不會太多，而且它們具有一定的經濟實力，具備購置無害化處理設施的能力，病死畜禽無害化處理基本不是問題。
2.作坊式養殖或小型規模化養殖
（1）它們設施簡陋，技術專業水平較低，管理粗放，是病死畜禽的主要來源。以養豬場為例，它們的飼養規模多在100～1 000頭左右，豬舍簡易、以夫妻養殖或雇用民工為主要人員，缺少技術人員，管理粗放，豬場很容易發病。浙江嘉興地區的生豬養殖基本是這種模式，一旦發病，大面積傳播，會在短時間產生大量的病死畜禽。簡易的深埋方式已經不能承受大量畜禽死亡處理的要求，這些養殖戶沒有實力購買新型的無害化處理設施。他們處理病死畜禽的方式就是丟棄或賣掉，既簡便又省力。這是他們的特點之一。
（2）養殖場畜禽發病呈周期性發生，每年冬春或秋冬交接、或夏季雨后是畜禽的死亡高峰期。在時間表上，病死畜禽數量呈現出忽高忽低的形勢，很難利用新型無害化處理設施開展持續性作業，往往造成設備的閑置和浪費。
（3）作坊式、小型規模養殖場在地域上分布分散，病死畜禽的收集會產生大量成本，這無疑給無害化處理造成障礙。
