2016年，各級獸醫部門認真貫徹農業部緊密圍繞獸醫工作“防風險、保安全、促發展”的目標任務，強化從養殖到屠宰全鏈條獸醫衛生風險管理，各項工作取得顯著成效，實現了“十三五”時期獸醫事業良好開局。
著力提高動物防疫工作科學化水平，有效防范動物疫病風險。聯合財政部優化動物疫病防控支持政策，推進強制免疫“先打后補”政策實施；建立強制免疫和撲殺病種財政補助進入退出機制；調整國家強制免疫和撲殺補助病種。出臺口蹄疫、高致病性禽流感、布魯氏菌病、狂犬病等重點單項病防治計劃。印發《大東北免疫無口蹄疫區建設指導意見》。膠東半島免疫無口蹄疫區和免疫無高致病性禽流感區通過國家評估驗收，第一次在一個區域內實現了兩種重大動物疫病的免疫凈化。規范活畜長途調運監管，實現跨省調運活畜禽檢疫證明電子出證全國互聯互通。
著力完善動物源性食品安全保障機制，切實保障動物源性食品安全。深入開展獸用抗菌藥專項整治、獸用抗菌藥五年行動，開展人獸共用抗菌藥風險評估。強化生豬屠宰監管，出臺《農業部關于加強屠宰行業管理，保障肉品質量安全的意見》《生豬屠宰監督檢查操作規范》。組織開展生豬屠宰監管“掃雷行動”，嚴查重點風險區域、盯緊重點監管目標、嚴打重點違法行為。“掃雷行動”啟動以來，全國已查處屠宰違法案件4839起，移送公安機關415起，搗毀私屠濫宰窩點2715個，取締不符合條件的生豬屠宰場點1928個。完善病死畜禽無害化處理機制，截至目前，全國已建成和在建專業無害化處理場526個，各地養殖環節無害化處理病死豬2670萬頭。
著力抓好獸藥行業監管，促進獸藥產業健康發展。發布《農業部關于促進獸藥產業健康發展的指導意見》，推動建立新獸藥注冊現場核查制度，加強新獸藥注冊監管。規范獸藥標簽和說明書，修訂《獸藥標簽和說明書管理辦法》。組織開展10次假獸藥查處活動，共抽檢獸藥產品近1.09萬批，合格1.05萬多批，合格率96.6%。積極推進獸藥“二維碼”追溯制度實施，“二維碼”追溯基本實現對生產企業、獸藥產品兩個“全覆蓋”。
經過全國獸醫工作者的共同努力，全年獸醫衛生工作目標已基本完成，在國際重大動物疫情頻發的大背景下，全國重大動物疫情繼續保持總體平穩，有力保障了養殖業生產安全、動物源性食品安全、公共衛生安全和生態安全。
